番組タイトルのロゴはカラーこそ変更があったものの、基本的なデザインは9年間変わっていない。このタイトルロゴは、数々の映画作品のロゴやポスターのデザインを手がけてきた檜垣紀六氏によって制作され、番組では第100回・1994年3月26日放送まで番組エンディングのクレジットにもお名前が表示されていた。
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ロゴを見てお分かりの通り、この番組のタイトルは『マジカル頭脳パワー』ではなく『マジカル頭脳パワー!!』である。
第241回・1998年7月30日放送よりロゴの色が銀色から青色になった。
この青色ロゴはこの先のレギュラー放送では使われたが、大マジカル頭脳パワー!!では使われていない。
(1998年秋の大マジカルはタイトルロゴが使われず、1999年新春の大マジカルはこの回だけ唯一ロゴが金色)
スペシャルでこの青色ロゴが使われたのは2001年の復活スペシャルだけ。
番組本や新聞・雑誌などの番組広告といった印刷物などによく使われていたタイプのロゴ。文字の縁取りの中に細かい線が多数描かれている。
番組内では司会者が手に持つ台本メモ、初期パネラー席にあった解答モニター、ごく初期のブルーバックのEND画面などで用いられている。
「MAGICAL」の頭文字「M」をかたどったと思われるシンボルマーク。
大マジカル頭脳パワー!!のチームボックス席にデザインされたのが最初で、以降レギュラー放送でもパネラー席やコーナーごとに使われる解答ボックスなど番組セットのさまざまな部分で使われた。
凹五角形をしているこのシンボルマーク。くぼみの部分は、図のように正方形の縦の上3分の1の部分と横2分の1の部分から
直線を引いて交わる部分に置くと上手く描くことができる。
このデザインのシンボルマークが初めて登場したのは「大マジカル頭脳パワー!!スペシャルⅣ」。
それ以前のデザインは・・・